בכדי לתכנן תכן אופטימלי ויעיל, מהנדסים מפתחים את מערכות התוכנה והחלקים הפיסיקליים בסביבה אחת.
יכולות המידול הפיסי של סביבת Simulink מאפשרים להוסיף דיוק ויעילות לתהליך זה, ובתוך כך לאפשר:

• בניית מודלים מערכתיים הכוללים מכלולים רב-תחומיים, יחד עם מערכת הבקרה
• יצירה של מודלים הניתנים לשימוש חוזר של מערכות פיסיקליות (מכניים, אלקטרוניים, הידראוליים, תרמיים וכו')
• מידול רכיבים ייחודיים בעזרת תכנות בשפת MATLAB
• יכולות ויזואליזציה ב-3D לצורך קבלת מידע מעמיק יותר על המערכת ועל אופן ההרצה

מכל המכלולים הללו ניתן לייצר קוד ולאפשר סימולציות זמן-אמת בגישת (Hardware-In-The-Loop (HIL.